2007. gadā advokātu birojs Covingtoh & Burling LLP, kas pārstāv septiņu Spānijas investoru - Jukos akcionāru - intereses, Stokholmas Starptautiskajā šķīrējtiesā iesniedza prasību pret Krieviju. Prasītāji pieprasīja kompensāciju no Krievijas valdības, atsaucoties uz faktu, ka Krievijas Federācijas valsts un tiesu iestāžu darbības rezultātā viņiem tika nodarīti finansiāli zaudējumi. Un saskaņā ar Krievijas un Spānijas vienošanos par ieguldījumu savstarpēju aizsardzību zaudējumi, kas investoriem radušies valsts prettiesiskas rīcības rezultātā, ir kompensējami.
Tiesvedības būtība bija tāda, ka Krievijas puse apzināti bankrotēja YUKOS, kas nodarīja finansiālu kaitējumu uzņēmuma akcionāriem. Pilnvarotās personas no Krievijas, piedaloties Stokholmas arbitrāžā kā atbildētājs, prasību neatzina, jo, viņuprāt, Jukos vadība ilgu laiku izvairījās no nodokļu maksāšanas īpaši lielā apmērā un izdarīja citus likumu pārkāpumus. Krievijas Federācijas. Tieši tas izraisīja krimināllietas pret YUKOS vadību, kā arī tās bankrotu.
Tomēr Stokholmas šķīrējtiesa nostājās prasītāju pusē, nospriežot, ka Krievijai viņiem jāmaksā 2,7 miljoni ASV dolāru kompensācijai par radušajiem zaudējumiem. Zaudējumu summa tika aprēķināta, pamatojoties uz YUKOS kapitalizācijas summu tās bankrota laikā. Šķīrējtiesas lēmumā tika uzsvērts, ka nodokļu prasības ir tikai iegansts Jukos aktīvu arestēšanai, un uzņēmuma vadības kriminālvajāšanas faktiskais mērķis bija vēlme nevis likumīgi iekasēt nodokļus, bet gan atsavināt uzņēmumu. Tas ir, tiesa nonāca pie secinājuma, ka Krievijas puse apzināti bankrotēja YUKOS, lai valsts uzņēmumi Rosņeft un Gazprom saņemtu lielāko daļu tā aktīvu. Jāatzīmē, ka šis ir jau otrais Stokholmas arbitrāžas tiesas lēmums, kurš, balstoties uz Jukos akcionāru prasībām, nebija Krievijai par labu.
Kāpēc Krievija zaudē šādas prasības starptautiskajā šķīrējtiesā? Var, protams, atsaukties uz masveida propagandas kampaņu, kuras rezultātā bijušais Jukos vadītājs M. Hodorkovskis Rietumu sabiedriskās domas acīs parādījās kā opozicionārs, kurš cieta par savu politisko un demokrātisko pārliecību. Var norādīt uz Zviedrijas valdošo aprindu ļoti nedraudzīgo attieksmi pret Krieviju. Neskatoties uz to, fakts paliek fakts: rietumos viņi uzskata, ka Krievijas varas iestādes Jukos afērā ir pārkāpušas īpašuma tiesības. Un pats jēdziens "īpašums" tur ir svēts.
Līdzīgu lēmumu pieņēma Strasbūras Cilvēktiesību tiesa, kas, kaut arī atzina, ka Jukos un tā vadības vajāšana nebija politiski motivēta, tomēr norādīja arī uz īpašuma tiesību pārkāpumu uzņēmuma aktīvu pārdalē.